复旦大学附属中山医院教育处是医院的教育教学管理机构，由医院党政班子全面领导，副院长直接领导分管，教育处下设本科教育科、研究生科、规范化培训科和继续教育科，另设远程医学教育中心、临床技能培训中心。学生党总支由医院党委直接领导。

自1937年开业至今，医院教育教学职能已包括了医学院校教育、毕业后医学教育和继续医学教育完整的医学教育阶段，成为孕育和培养国家优秀医学人才的摇篮。是国家教育部认定的首批国家临床教学培训示范中心，有博士点18个，硕士点21个，博士生导师177人，硕士生导师227人，是复旦大学临床医学博士后流动站，医院现有教师资格证师资1000余人，每年在培医学生和研究生1000余人。经国家卫生健康委员会和上海市卫生健康委员会批准的住院医师规范化培训专业基地21个，其中国家住院医师规范化培训重点专业基地7个（上海市最多），中国住院医师培训精英教学医院联盟成员单位，每年在院规范化培训的住院医师600余名；专科医师规范化培训基地30个，在院规范化培训专科医师300余名。是国家卫生健康委员会授予的首批国家住院医师规范化培训示范基地，全国首个全科医学师资培训示范（试点）基地，全科医师规范化培训体系通过了WONCA(世界家庭医师协会）毕业后医学教育标准认证，中山医院成为全球首家通过该认证的单位。是国家卫生健康委员会授予临床药师（心内科、呼吸科、抗肿瘤、抗感染）培训基地、内镜（消化内镜、经皮肾镜）培训基地、心血管（先天性心脏病、心血管介入、心律失常）培训基地、临床药师师资培训基地、继续医学教育（肝病研究所、心血管病研究所、呼吸病研究所、影像医学研究所）基地。是全国继续医学教育委员会授予的首批远程继续医学教育机构。每年来院参观和进修医生1400余名，举办国家级继续医学教育（含远程）学习班100余期，为国家培养了大量德医双馨的医学业务骨干和学科带头人。

近十年来，主编各类教材30余本，发表教学论文300余篇；荣获国家教学成果二等奖1项，上海市教学成果特等奖1项、上海市教学成果一等奖2项、二等奖3项；作为主要研究单位，荣获国家教学成果特等奖1项、上海市教学成果特等奖2项。荣获教育部“宝钢优秀教师特等奖”、全国高等医学院校青年教师教学基本功比赛一等奖和最佳教案奖、上海市政府“上海市教育功臣”、上海市教育委员会 “上海市教书育人楷模”。囊括了中国医师协会全国“十佳住培基地负责人”、“十佳住培管理工作者”、“十佳优秀住院医师”、“优秀专业基地主任”、“住院医师心中好老师”、“十佳全科专业基地”、“优秀全科专业指导老师”、“优秀青年全科医生”等荣誉。